Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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