Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNXAQ16473 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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TNXAQ16473 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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TNXAQ16473 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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TNXAQ16473 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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TNXAQ16473 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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TNXAQ16473 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNXAQ16473 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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