Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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SIX1Q15475 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SIX1Q15475 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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