Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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SYCP1Q15431 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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SYCP1Q15431 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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SYCP1Q15431 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SYCP1Q15431 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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SYCP1Q15431 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SYCP1Q15431 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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