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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL592045.1-201 | ENST00000429867 | 352 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RPS20P5-201 | ENST00000434808 | 360 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC093156.1-201 | ENST00000440382 | 670 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL589684.1-201 | ENST00000445974 | 507 nt | TSL 3 BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | MYL12B-204 | ENST00000584539 | 1064 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC010889.1-201 | ENST00000566193 | 2666 nt | BASIC | 2.37 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ZMYM1-210 | ENST00000611874 | 4466 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AK9-203 | ENST00000368948 | 2478 nt | TSL 5 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | GABRG2-209 | ENST00000638660 | 3799 nt | TSL 5 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | DEFA7P-201 | ENST00000382676 | 285 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL158840.1-201 | ENST00000414132 | 523 nt | TSL 3 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | BX682237.1-201 | ENST00000415016 | 335 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | LINC00407-201 | ENST00000426509 | 295 nt | TSL 5 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC093106.2-201 | ENST00000428212 | 385 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC022080.3-201 | ENST00000544433 | 482 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AL359999.1-201 | ENST00000604513 | 294 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC011939.3-201 | ENST00000613686 | 466 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC027807.2-201 | ENST00000616099 | 408 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | CCDC82-202 | ENST00000423339 | 1878 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | PHTF2-202 | ENST00000275575 | 4541 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | TIMM9-202 | ENST00000395159 | 1336 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MACC1-202 | ENST00000400331 | 9159 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC092593.1-201 | ENST00000515413 | 1815 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ZNF804A-202 | ENST00000613975 | 3986 nt | TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AKAP9-203 | ENST00000359028 | 12247 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ERBIN-202 | ENST00000380935 | 6692 nt | TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC080100.1-201 | ENST00000624239 | 5356 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | ADAM3A-203 | ENST00000461344 | 2157 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | NACAP2-201 | ENST00000318548 | 624 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNU5E-6P-201 | ENST00000365574 | 115 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AKR1C1-201 | ENST00000380859 | 858 nt | TSL 3 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNU6-851P-201 | ENST00000384565 | 107 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MIR592-201 | ENST00000384959 | 97 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
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| ATXN7L3 | Q14CW9 | EIF4EBP2P3-201 | ENST00000403144 | 334 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | FCF1P10-201 | ENST00000407590 | 479 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | SNORA11-201 | ENST00000408789 | 128 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | Y_RNA.608-201 | ENST00000410647 | 95 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RNU2-25P-201 | ENST00000411041 | 191 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RPS12P24-201 | ENST00000412619 | 387 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | EEF1A1P41-201 | ENST00000414667 | 207 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | SEPT2P1-201 | ENST00000419651 | 180 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AC093843.1-201 | ENST00000424395 | 512 nt | TSL 2 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RPL35AP12-201 | ENST00000425362 | 338 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | LINC01037-201 | ENST00000427337 | 424 nt | TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MTND5P25-201 | ENST00000430499 | 799 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | OSTCP8-201 | ENST00000445117 | 448 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MTATP6P7-201 | ENST00000453315 | 681 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RPL30P6-201 | ENST00000475925 | 342 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | RPS29P26-201 | ENST00000477483 | 171 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AP000797.1-201 | ENST00000478870 | 387 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | MTCYBP35-201 | ENST00000503630 | 1137 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | AP002075.1-201 | ENST00000505091 | 603 nt | TSL 3 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATXN7L3 | Q14CW9 | PRR16-204 | ENST00000505123 | 1298 nt | TSL 3 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |