Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ATRQ13535 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ATRQ13535 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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