Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ATMQ13315 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ATMQ13315 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
ATMQ13315 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ATMQ13315 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ATMQ13315 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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