Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CLN3Q13286 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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