Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BNIP1Q12981 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.59□□□□□ -2
BNIP1Q12981 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.59□□□□□ -2
BNIP1Q12981 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
BNIP1Q12981 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
BNIP1Q12981 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BNIP1Q12981 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms