Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GRIN2AQ12879 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
GRIN2AQ12879 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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