Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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