Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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ZNF239Q16600 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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ZNF239Q16600 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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ZNF239Q16600 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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ZNF239Q16600 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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ZNF239Q16600 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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ZNF239Q16600 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ZNF239Q16600 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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