Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHRNA6Q15825 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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