Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PUM3Q15397 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PUM3Q15397 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PUM3Q15397 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PUM3Q15397 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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