Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB35Q15286 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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RAB35Q15286 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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RAB35Q15286 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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RAB35Q15286 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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RAB35Q15286 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RAB35Q15286 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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