Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDCD1Q15116 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms