Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms