Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DDX39BQ13838 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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