Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SP140Q13342 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SP140Q13342 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SP140Q13342 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
SP140Q13342 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SP140Q13342 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SP140Q13342 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SP140Q13342 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SP140Q13342 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SP140Q13342 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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