Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NME3Q13232 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NME3Q13232 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
NME3Q13232 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
NME3Q13232 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
NME3Q13232 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
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NME3Q13232 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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NME3Q13232 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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NME3Q13232 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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NME3Q13232 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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NME3Q13232 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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NME3Q13232 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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NME3Q13232 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NME3Q13232 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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