Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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