Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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GRIK3Q13003 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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GRIK3Q13003 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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GRIK3Q13003 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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GRIK3Q13003 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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