Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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