Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms