Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms