Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TTPAP49638 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TTPAP49638 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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