Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CENPFP49454 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CENPFP49454 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CENPFP49454 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CENPFP49454 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CENPFP49454 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CENPFP49454 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CENPFP49454 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CENPFP49454 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CENPFP49454 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CENPFP49454 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CENPFP49454 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CENPFP49454 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CENPFP49454 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CENPFP49454 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CENPFP49454 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CENPFP49454 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CENPFP49454 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CENPFP49454 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CENPFP49454 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
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CENPFP49454 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPFP49454 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPFP49454 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CENPFP49454 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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CENPFP49454 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
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CENPFP49454 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
CENPFP49454 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
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CENPFP49454 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
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CENPFP49454 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
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CENPFP49454 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
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CENPFP49454 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPFP49454 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPFP49454 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
CENPFP49454 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
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