Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPREP23469 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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PTPREP23469 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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PTPREP23469 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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PTPREP23469 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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PTPREP23469 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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PTPREP23469 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPREP23469 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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