Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERVV-1B6SEH8 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERVV-1B6SEH8 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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