Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
BRPF3Q9ULD4 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
BRPF3Q9ULD4 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms