Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KNOP1Q1ED39 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KNOP1Q1ED39 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160 ms