Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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