Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLPPQ16740 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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