Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SGCBQ16585 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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