Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
SNAPC1Q16533 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNAPC1Q16533 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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