Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SSX1Q16384 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SSX1Q16384 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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