Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHHQ15465 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SHHQ15465 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SHHQ15465 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHHQ15465 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHHQ15465 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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