Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERC3Q15034 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.8 ms