Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ALCAMQ13740 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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