Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL1Q13616 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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