Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
HDAC1Q13547 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HDAC1Q13547 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms