Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PRPF4BQ13523 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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