Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MSLNQ13421 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms