Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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TRAF3Q13114 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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TRAF3Q13114 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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TRAF3Q13114 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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TRAF3Q13114 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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TRAF3Q13114 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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