Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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TRAF1Q13077 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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TRAF1Q13077 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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TRAF1Q13077 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
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TRAF1Q13077 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TRAF1Q13077 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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