Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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FOXF2Q12947 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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FOXF2Q12947 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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FOXF2Q12947 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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FOXF2Q12947 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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FOXF2Q12947 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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FOXF2Q12947 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
FOXF2Q12947 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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