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| FOXF2 | Q12947 | RPL21P24-201 | ENST00000413752 | 448 nt | BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | MAP3K21-201 | ENST00000366622 | 4005 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | PCDH15-203 | ENST00000373955 | 4230 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.58 | □□□□□ -1.84 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | GALNT3-202 | ENST00000409882 | 2107 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | NOL8P1-201 | ENST00000508336 | 3529 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC107222.1-201 | ENST00000510899 | 637 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC006499.6-201 | ENST00000511169 | 607 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | SNORA67.7-201 | ENST00000516664 | 135 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-1016P-201 | ENST00000516689 | 94 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RN7SKP82-201 | ENST00000516786 | 223 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-388P-201 | ENST00000517012 | 105 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-389P-201 | ENST00000517048 | 105 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | KIRREL3-AS2-201 | ENST00000532988 | 492 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LINC00944-201 | ENST00000536517 | 421 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC022081.1-201 | ENST00000537327 | 433 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AF111169.4-202 | ENST00000553507 | 262 nt | TSL 3 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CYP4A43P-201 | ENST00000568156 | 121 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MIR5685-201 | ENST00000579080 | 79 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AC005357.1-201 | ENST00000588399 | 301 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC005255.1-201 | ENST00000593748 | 216 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ZNF432-203 | ENST00000597273 | 624 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC107031.1-201 | ENST00000604939 | 347 nt | TSL 2 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AL138726.1-201 | ENST00000614873 | 333 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | FAM157A-202 | ENST00000615155 | 405 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AL589994.2-201 | ENST00000621124 | 579 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC018692.1-202 | ENST00000623559 | 676 nt | TSL 5 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AL732372.2-225 | ENST00000642124 | 456 nt | BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SELENOI-201 | ENST00000260585 | 8101 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ZNF594-201 | ENST00000399604 | 4862 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.57 | □□□□□ -1.84 | | |