Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	HTR2A-AS1-202	ENST00000452352	384 nt	TSL 2 BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AL589678.1-201	ENST00000452685	561 nt	TSL 3 BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC091133.4-201	ENST00000511142	308 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	SNRPGP16-201	ENST00000533275	226 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC007513.1-201	ENST00000548740	379 nt	TSL 3 BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	ZNF519P2-201	ENST00000557032	169 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	DEFB131E-202	ENST00000602581	683 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AL161729.4-201	ENST00000604650	476 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	HMGN2P28-201	ENST00000606102	262 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	ZNRD1-AS1_3.8-201	ENST00000611686	104 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	U4.5-201	ENST00000617137	123 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	Xist_exon1.1-201	ENST00000618930	85 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC136475.10-201	ENST00000620253	385 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	ABCC9-206	ENST00000621589	450 nt	TSL 5 BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC009161.2-201	ENST00000624626	138 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC019226.1-201	ENST00000625666	515 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	SEPT14P19-203	ENST00000633205	211 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	KNTC1-201	ENST00000333479	6975 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	OXR1-207	ENST00000497705	2007 nt	TSL 2 BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	SULT1B1-201	ENST00000310613	7115 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	C6orf10-204	ENST00000447241	2148 nt	APPRIS P3 TSL 5 BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MTND5P3-201	ENST00000438536	1800 nt	BASIC	3.4	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	HSFY2-201	ENST00000304790	1444 nt	APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	HSFY1-201	ENST00000307393	1444 nt	APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC025164.2-202	ENST00000499685	5699 nt	TSL 3 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	HMGN5-201	ENST00000358130	2126 nt	APPRIS P2 TSL 2 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MPDZ-215	ENST00000541718	7603 nt	APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	CENPE-201	ENST00000265148	8612 nt	APPRIS P1 TSL 2 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	SPAM1-202	ENST00000340011	2349 nt	APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	Y_RNA.6-201	ENST00000362350	114 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	Y_RNA.516-201	ENST00000384541	124 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNU6-837P-201	ENST00000391056	108 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC007283.2-201	ENST00000424739	197 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AL031667.1-201	ENST00000440222	725 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	UBE2Q2P9-201	ENST00000490086	202 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	FAM60DP-201	ENST00000524174	632 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AP003072.2-201	ENST00000527756	676 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC009511.1-201	ENST00000543527	191 nt	TSL 5 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	OR5V1-216	ENST00000543825	1048 nt	APPRIS P1 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC011773.2-201	ENST00000551479	285 nt	TSL 5 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC124947.2-202	ENST00000552735	133 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC009269.3-201	ENST00000558429	472 nt	TSL 5 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	SMG1P7-203	ENST00000573141	619 nt	TSL 2 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RBM11P1-201	ENST00000604951	799 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC007038.2-201	ENST00000608095	740 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC093838.1-201	ENST00000613014	469 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	SOX2-OT-255	ENST00000630150	649 nt	TSL 5 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	LINC01002-202	ENST00000631412	459 nt	TSL 5 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AP003171.2-202	ENST00000634657	355 nt	TSL 5 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	TPTE2-203	ENST00000390680	1558 nt	TSL 1 (best) BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	DDX10P1-201	ENST00000448545	1933 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MDM2-207	ENST00000360430	891 nt	TSL 1 (best) BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNY1P12-201	ENST00000364251	105 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNU6-1322P-201	ENST00000364309	107 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNU6-248P-201	ENST00000410720	107 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RN7SKP58-201	ENST00000411010	305 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MTCO1P39-201	ENST00000426148	480 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC091133.1-201	ENST00000435491	483 nt	TSL 3 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC007879.4-201	ENST00000440545	361 nt	TSL 3 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AL513124.1-201	ENST00000450410	614 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RN7SL633P-201	ENST00000488974	297 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC023794.1-201	ENST00000504210	403 nt	TSL 2 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	LINC02377-202	ENST00000505436	523 nt	TSL 5 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	CSN1S1-202	ENST00000505782	871 nt	APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC008883.2-201	ENST00000505796	414 nt	TSL 3 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	CSN1S1-204	ENST00000507772	895 nt	APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC009646.1-201	ENST00000510455	318 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNU6-1095P-201	ENST00000516148	108 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC018437.2-201	ENST00000517369	389 nt	TSL 5 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC109635.4-202	ENST00000531666	412 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC091047.1-201	ENST00000533344	552 nt	TSL 4 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	PWRN1-209	ENST00000568019	359 nt	TSL 3 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AL161734.1-201	ENST00000609720	557 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC068880.5-201	ENST00000624331	290 nt	BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	ATM-203	ENST00000452508	12954 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MUC7-202	ENST00000413702	2540 nt	APPRIS P2 TSL 4 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	DNAH12-201	ENST00000311202	1555 nt	TSL 2 BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	SENP7-206	ENST00000394094	4703 nt	APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC	3.39	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	PALMD-205	ENST00000615664	1844 nt	TSL 5 BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	C5orf51-201	ENST00000381647	5241 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	LINC01111-201	ENST00000518732	1663 nt	TSL 1 (best) BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MIR148B-201	ENST00000362252	99 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNU6-297P-201	ENST00000384636	107 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MIR19A-201	ENST00000384878	82 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	TRDJ1-201	ENST00000390473	51 nt	APPRIS P1 BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RPL21P3-201	ENST00000395517	478 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	TOMM20P4-201	ENST00000427861	435 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC002486.1-201	ENST00000435098	391 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC004866.2-201	ENST00000438285	481 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AL022238.1-201	ENST00000442557	355 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	EEF1B2P7-201	ENST00000451177	676 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC069549.1-201	ENST00000451584	499 nt	TSL 3 BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MTND1P12-201	ENST00000455231	147 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC146507.2-201	ENST00000460608	476 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	UMAD1-204	ENST00000482067	569 nt	TSL 5 BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC010587.1-201	ENST00000505809	469 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC060765.1-201	ENST00000522776	544 nt	TSL 4 BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	LIVAR-201	ENST00000578633	384 nt	TSL 3 BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MIR4524B-201	ENST00000581569	115 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC010928.3-201	ENST00000587712	541 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87

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