Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms