Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
CITED1Q99966 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CITED1Q99966 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms