Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SNX29Q8TEQ0 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms